慈雲寺一帶的林相以紅檜林為主,周遭栽植日本黑松、茶花、木蘭、阿里山十大功勞,附近矗立殉職紀念的旄功碑與樹靈塔。
從阿里山工作站循步道經象鼻木據點至慈雲寺,可見高山植物園,春天可以看到桃葉珊瑚、玉山杜鵑、深紅茵芋、深山野牡丹、西施花、台灣馬醉木等開花株;邊坡山桔梗集生開花株。