台灣特有種植物
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台灣特有種植物列表 Endemic plants in Taiwan
參考資料:Flora 二版第六冊名錄註記Endemic名錄
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八十三千大小山五天木毛水火牛仙冬
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八角科 Illiciaceae
- 台灣八角 Illicium arborescens Hayata (特有種)
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十字花科 Brassicaceae
- 台灣筷子芥 Arabis formosana (Masam. ex S. F. Huang) Liu & Ying (特有種)
- 山芥菜 Barbarea orthoceras Ledeb. (瀕臨絕滅)
- 台灣山芥菜 Barbarea taiwaniana Ohwi (特有種)
- 阿玉碎米薺 Cardamine agyokumontana Hayata (特有種)
- 腎葉碎米薺 Cardamine reniformis Hayata (特有種)
- 台灣碎米薺 Cardamine hirsuta L. var. formosana Hayata. (特有種)
- 台灣假山葵 Cochlearia formosana Hayata (特有種)
- 台灣山薺 Draba sekiyana Ohwi (稀有)
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三尖杉科 Cephalotaxaceae
- 台灣粗榧 Cephalotaxus wilsoniana Hayata (稀有)
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大花草科 Rafflesiaceae
- 菱形奴草 Mitrastemon kanehirai Yamamoto (瀕臨絕滅)
- 台灣奴草 Mitrastemon kawasasakii Hayata (稀有)
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大戟科 Euphorbiaceae
- 屏東鐵莧 Acalypha akoensis Hayata 併入台灣鐵莧 (特有種)
- 紅頭鐵莧 Acalypha hontauyuensis Keng (疑問種)
- 恆春鐵莧 Acalypha matudai Hayata (受到威脅)
- 小葉鐵莧 Acalypha minima Keng (特有種)
- 花蓮鐵莧 Acalypha suirenbiensis Yamamoto (稀有)
- 台灣山麻桿 Alchornea trewioides (Benth.) Muell.-Arg. var. formosae (Muell.-Arg.) Pax & Hoffm. (特有種)
- 南仁五月茶 Antidesma hiiranense Hayata (受到威脅)
- 南投五月茶 Antidesma japonicum Sieb. & Zucc. (特有種)
- 鵝鑾鼻大戟 Chamaesyce garanbiensis (Hayata) Hara (受到威脅)
- 新竹地錦 Chamaesyce hsinchuensis Lin & Chaw (特有種)
- 台西大戟 Chamaesyce taihsiensis Chaw & Koutnik (疑問種)
- 田代氏大戟 Chamaesyce tashiroi (Hayata) Hara (特有種)
- 交力坪鐵色 Drypetes karapinensis (Hayata) Pax (特有種)
- 台灣大戟 Euphorbia formosana Hayata (稀有)
- 霞山大戟 Euphorbia shouanensis Keng (疑問種)
- 太魯閣大戟 Euphorbia tarokoensis Hayata (受到威脅)
- 蘭嶼土沉香 Excoecaria kawakamii Hayata (受到威脅)
- 白樹仔 Gelonium aequoreum Hance (特有種)
- 台灣假黃楊 Liodendron formosanum (Kanehira & Sasaki) Keng (稀有)
- 臺灣白匏子 Mallotus paniculatus (Lam.) Muell. -Arg. var. formosanus (Hayata) Hurusawa (特有種)
- 新竹油柑 Phyllanthus oligospermus Hayata (特有種)
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小檗科 Berberidaceae
- 長葉小蘗 Berberis aristatoserrulata Hayata (稀有)
- 高山小蘗 Berberis brevisepala Hayata (特有種)
- 清水山小蘗 Berberis chingshuiensis Shimizu (受到威脅)
- 台灣小蘗 Berberis kawakamii Hayata (特有種)
- 眠月小蘗 Berberis mingetsuensis Hayata (特有種)
- 玉山小蘗 Berberis morrisonensis Hayata (特有種)
- 太魯閣小蘗 Berberis tarokoensis Lu & Yang (受到威脅)
- 阿里山十大功勞 Mahonia oiwakensis Hayata (特有種)
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山柑科 Capparaceae
- 魚木 Crateva adansonii DC. subsp. formosensis Jacobs (特有種)
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山茱萸科 Cornaceae
- 台灣青莢葉 Helwingia japonica (Thunb.) Dietr. subsp. taiwaniana Y. P. Yang & H. Y. Liu (特有種)
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山龍眼科 Proteaceae
- 蓮花池山龍眼 Helicia rengetiensis Masam. (特有種)
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五加科 Araliaceae
- 台灣八角金盤 Fatsia polycarpa Hayata (特有種)
- 台灣常春藤 Hedera rhombea (Miq.) Bean var. formosana (Nakai) Li (特有種)
- 台灣五葉參 Pentapanax castanopsisicola Hayata (特有種)
- 台灣鵝掌柴 Schefflera taiwaniana (Nakai) Kanehira (特有種)
- 華參 Sinopanax formosana (Hayata) Li (特有種)
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五味子科 Schisandraceae
- 阿里山五味子 Schisandra arisanensis Hayata (特有種)
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天南星科 Araceae
- 台灣魔芋 Amorphophallus henryi N. E. Br. (特有種)
- 密毛魔芋 Amorphophallus hirtus N. E. Br. (稀有)
- 台灣天南星 Arisaema formosanum (Hayata) Hayata (特有種)
- 毛筆天南星 Arisaema grapsospadix Hayata (特有種)
- 宜蘭天南星 Arisaema ilanense J. C. Wang (疑問種)
- 線花天南星 Arisaema matsudae Hayata (特有種)
- 南仁山天南星 Arisaema nanjenense T. C. Huang & M. J. Wu (疑問種)
- 蓬萊天南星 Arisaema taiwanense J. Murata (特有種)
- 短梗天南星 Arisaema taiwanense J. Murata var. brevipedunculatum J. Murata 併入蓬萊天南星 (疑問種)
- 東台天南星 Arisaema thunbergii Blume subsp. autumnale J. C. Wang, J. Murata & H. Ohashi (疑問種)
- 台灣青芋 Colocasia formosana Hayata (特有種)
- 台灣拎樹藤 Epipremnum formosanum Hayata (疑問種)
- 基隆扁葉芋 Homalomena kelungensis Hayata (疑問種)
- 蘭嶼芋 Schismatoglottis kotoensis (Hayata) T. C. Huang (受到威脅)
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木通科 Lardizabalaceae
- 紫花野木瓜 Stauntonia purpurea Y. C. Liu & F. Y. Lu (特有種)
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木犀科 Oleaceae
- 玉山女貞 Ligustrum morrisonense Kanehira & Sasaki (稀有)
- 異葉木犀 Osmanthus heterophyllus (G. Don) P. S. Green (特有種)
- 高氏木犀 Osmanthus kaoi (Liu & Liao) S. Y. Lu (特有種)
- 銳葉木犀 Osmanthus lanceolatus Hayata (特有種)
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木蘭科 Magnoliaceae
- 烏心石舅 Magnolia kachirachirai (Kanehira & Yamamoto) Dandy (稀有)
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毛茛科 Ranunculaceae
- 蔓烏頭 Aconitum fukutomei Hayata var. formosanum (Tamura) Yang & Huang (稀有)
- 台灣烏頭 Aconitum fukutomei Hayata var. fukutomei (特有種)
- 屏東鐵線蓮 Clematis akoensis Hayata (稀有)
- 台灣鐵線蓮 Clematis formosana Kuntz. (稀有)
- 梨山小蓑衣藤 Clematis gouriana Roxb. ex DC. subsp. lishanensis Yang & Huang (特有種)
- 森氏鐵線蓮 Clematis henryi Oliv. var. morii (Hayata) Yang & Huang (特有種)
- 巴氏鐵線蓮 Clematis parviloba Gard. ex Champ. subsp. bartlettii (Yamamoto) Yang (稀有)
- 台灣草牡丹 Clematis psilandra Kitagawa (稀有)
- 田村氏鐵線蓮 Clematis tamurae Yang & Huang (特有種)
- 鵝鑾鼻鐵線蓮 Clematis terniflora DC. var. garanbiensis (Hayata) M. C. Chang (受到威脅)
- 高山鐵線蓮 Clematis tsugetorum Ohwi (稀有)
- 掌葉毛莨 Ranunculus cheirophyllus Hayata (特有種)
- 蓬萊毛茛 Ranunculus formosa-montanus Ohwi (特有種)
- 高山毛茛 Ranunculus junipericola Ohwi (特有種)
- 森氏毛莨 Ranunculus morii (Yamamoto) Ohwi (瀕臨絕滅)
- 南湖毛茛 Ranunculus nankotaizanus Ohwi (疑問種)
- 鹿場毛茛 Ranunculus taisanensis Hayata (疑問種)
- 密葉唐松草 Thalictrum myriophyllum Ohwi (稀有)
- 南湖唐松草 Thalictrum rubescens Ohwi (稀有)
- 玉山唐松草 Thalictrum sessile Hayata (稀有)
- 大花傅氏唐松草 Thalictrum urbaini Hayata var. majus T. Shimizu (稀有)
- 傅氏唐松草 Thalictrum urbaini Hayata var. urbaini (特有種)
- 台灣金蓮花 Trollius taihasenzanensis Masam. (稀有)
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水玉簪科 Burmanniaceae
- 台灣水玉杯 Thismia taiwanensis Yang, Saunders & Hsu (瀕臨絕滅)
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水蕹科 Aponogetonaceae
- 水蕹 Aponogeton taiwanensis Masam. (疑問種)
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冬青科 Aquifoliaceae
- 阿里山冬青 Ilex arisanensis Yamamoto (稀有)
- 苗栗冬青 Ilex bioritsensis Hayata (特有種)
- 早田氏冬青 Ilex hayataiana Loes. (特有種)
- 忍冬葉冬青 Ilex lonicerifolia Hayata var. lonicerifolia (稀有)
- 松田氏冬青 Ilex lonicerifolia Hayata var. matsudai Yamamoto (稀有)
- 拉拉山冬青 Ilex rarasanensis Sasaki (稀有)
- 鈴木冬青 Ilex suzukii S. Y. Hu (特有種)
- 雪山冬青 Ilex tugitakayamensis Sasaki (稀有)
- 雲南冬青 Ilex yunnanensis Fr. var. parvifolia (Hayata) S. Y. Hu (特有種)
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玄玉甘田石禾列安灰百竹肉西夾忍杜
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玄參科 Scrophulariaceae
- 南湖碎雪草 Euphrasia nankotaizanensis Yamamoto (稀有)
- 太魯閣小米草 Euphrasia tarokoana Ohwi (受到威脅)
- 玉山小米草 Euphrasia transmorrisonensis Hayata (特有種)
- 台灣碎雪草 Euphrasia transmorrisonensis Hayata var. durietziana (Ohwi) T. C. Hu (稀有)
- 桃園石龍尾 Limnophila taoyuanensis Yuen P. Yang & S. H. Yen (瀕臨絕滅)
- 台南見風紅 Lindernia scutellariiformis Yamazaki (特有種)
- 高山通泉草 Mazus alpinus Masam. (特有種)
- 佛氏通泉草 Mazus fauriei Bonati (特有種)
- 台南通泉草 Mazus tainanensis T. H. Hsieh (疑問種)
- 台灣泡桐 Paulownia × taiwaniana T. W. Hu. & H. J. Chang (特有種)
- 高山馬先蒿 Pedicularis ikomai Sasaki (稀有)
- 雙鋸齒玄參 Scrophularia yoshimurae Yamazaki (特有種)
- 玉山水苦藚 Veronica morrisonicola Hayata (特有種)
- 貧子水苦藚 Veronica oligosperma Hayata (特有種)
- 台灣水苦藚 Veronica taiwanica Yamazaki (稀有)
- 新竹腹水草 Veronicastrum axillare (Siebold & Zucc.) Yamaz. var. simadae (Masam.) H. Y. Liu (疑問種)
- 台灣腹水草 Veronicastrum formosanum (Masam.) Yamazaki (疑問種)
- 高山腹水草 Veronicastrum kitamurae (Ohwi) Yamazaki (疑問種)
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田麻科 Tiliaceae
- 短莖繩黃麻 Corchorus aestuans L. var. brevicaulis (Hosok.) Liu & Lo (特有種)
- 菱葉捕魚木 Grewia rhombifolia Kanehira & Sasaki (特有種)
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石竹科 Caryophyllaceae
- 亞毛無心菜 Arenaria subpilosa (Hayata) Ohwi (特有種)
- 高山無心菜 Arenaria takasagomontana (Masam.) S. S. Ying (特有種)
- 阿里山卷耳 Cerastium arisanensis Hayata (特有種)
- 台灣卷耳 Cerastium formosanum Ohwi (特有種)
- 小瓣卷耳 Cerastium parvipetalum Hosok. (特有種)
- 玉山卷耳 Cerastium trigynum Vill. var. morrisonense (Hayata) Hayata (特有種)
- 巴陵石竹 Dianthus palinensis S. S. Ying (疑問種)
- 玉山石竹 Dianthus pygmaeus Hayata (特有種)
- 白花玉山石竹 Dianthus pygmaeus Hayata forma albiflorus (S. S. Ying) S. S. Ying (特有種)
- 台灣瞿麥 Dianthus superbus L. var. taiwanensis (Masam.) Liu & Ying (疑問種)
- 基隆蠅子草 Silene fortunei Vis. var. kiruninsularis (Masam.) Ying (特有種)
- 南湖大山蠅子草 Silene glabella (Ohwi) Hayata, S. S. Ying (疑問種)
- 台灣蠅子草 Silene morii Hayata (特有種)
- 玉山蠅子草 Silene morrison-montana (Hayata) Ohwi & Ohashi (特有種)
- 高山蠅子草 Silene transalpina (Hayata) S. S. Ying (特有種)
- 賽繁縷 Stellaria media (L.) Cyrill var. procera Klett & Richt. (特有種)
- 小花繁縷 Stellaria micrantha Hayata (特有種)
- 網脈繁縷 Stellaria reticulivena Hayata (特有種)
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禾本科 Poaceae
- 台灣鵝觀草 Agropyron formosanum Honda (特有種)
- 阿里山翦股穎 Agrostis infirma Buse var. arisan-montana (Ohwi) Veldkamp (特有種)
- 伯明翦股穎 Agrostis infirma Buse var. fukuyamae (Ohwi) Veldkamp (特有種)
- 粗梗藎草 Arthraxon pauciflorus Honda (瀕臨絕滅)
- 內門竹 Arthrostylidium naibunensis (Hayata) Lin (受到威脅)
- 台灣矢竹 Arundinaria kunishii Hayata (特有種)
- 包籜矢竹 Arundinaria usawai Hayata (特有種)
- 長枝竹 Bambusa dolichoclada Hayata (特有種)
- 火廣竹 Bambusa dolichomerithalla Hayata (特有種)
- 長毛八芝蘭竹 Bambusa pachinensis Hayata var. hirsutissima (Odashima) Lin (特有種)
- 八芝蘭竹 Bambusa pachinensis Hayata var. pachinensis (特有種)
- 烏葉竹 Bambusa utilis Lin (特有種)
- 川上短柄草 Brachypodium kawakamii Hayata (特有種)
- 台灣雀麥 Bromus formosanus Honda (特有種)
- 綠島細柄草 Capillipedium kwashotensis (Hayata) C. C. Hsu (受到威脅)
- 水山野青茅 Deyeuxia suizanensis (Hayata) Ohwi (特有種)
- 佛歐里馬唐 Digitaria fauriei Ohwi (特有種)
- 大絨馬唐 Digitaria magna (Honda) Tsuyama (特有種)
- 絨馬唐 Digitaria mollicoma (Kunth) Henrard (特有種)
- 絹毛馬唐 Digitaria sericea (Honda) Honda (特有種)
- 台灣油芒 Eccoilopus formosanus (Rendle) A. Camus (瀕臨絕滅)
- 佛歐里畫眉草 Eragrostis fauriei Ohwi (疑問種)
- 毛葉知風草 Eragrostis pilosiuscula Ohwi (受到威脅)
- 紫台蔗茅 Erianthus formosanus Stapf (特有種)
- 台灣羊茅 Festuca formosana Honda (特有種)
- 屏東鴨嘴草 Ischaemum akonense Honda (特有種)
- 毛穗鴨嘴草 Ischaemum aristatum L. var. momiyamai (Honda) C. C. Hsu (特有種)
- 小黃金鴨嘴草 Ischaemum setaceum Honda (特有種)
- 囊桴竹 Leptaspis formosana C. C. Hsu (瀕臨絕滅)
- 法利莠竹 Microstegium fauriei (Hayata) Honda (特有種)
- 曲膝莠竹 Microstegium geniculatum (Hayata) Honda (特有種)
- 短軸莠竹 Microstegium glaberrimum (Honda) Koidz. (特有種)
- 相馬莠竹 Microstegium somai (Hayata) Ohwi (特有種)
- 石竹 Phyllostachys lithophila Hayata (特有種)
- 桂竹 Phyllostachys makinoi Hayata (特有種)
- 台灣早熟禾 Poa formosae Ohwi (特有種)
- 南湖大山早熟禾 Poa nankoensis Ohwi (特有種)
- 基隆早熟禾 Poa sphondyodes Trin. var. kelungensis (Ohwi) Ohwi (受到威脅)
- 高山早熟禾 Poa taiwanicola Ohwi (特有種)
- 高砂早熟禾 Poa takasagomontana Ohwi (特有種)
- 細桿早熟禾 Poa tenuicula Ohwi (特有種)
- 尖葉裂稃草 Schizachyrium fragile (R. Br.) A. Camus var. shimadae (Ohwi) C. C. H (疑問種)
- 台南大油芒 Spodiopogon tainanensis Hayata (特有種)
- 其昌假蛇尾草 Thaumastochloa chenii C. C. Hsu (瀕臨絕滅)
- 台灣三毛草 Trisetum spicatum (L.) Rich. var. formosanum (Honda) Ohwi (特有種)
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安息香科 Styracaceae
- 烏皮九芎 Styrax formosana Matsum. (特有種)
- 恒春野茉莉 Styrax formosana Matsum. var. hayataiana (Perkins) Li (特有種)
- 台灣野茉莉 Styrax matsumuraei Perkins (稀有)
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灰木科 Symplocaceae
- 薄葉灰木 Symplocos eriostroma Hayata (特有種)
- 恆春灰木 Symplocos koshunensis Kaneh. (瀕臨絕滅)
- 擬日本灰木 Symplocos migoi Nagam. (特有種)
- 小葉白筆 Symplocos modesta Brand (特有種)
- 玉山灰木 Symplocos morrisonicola Hayata (特有種)
- 能高山灰木 Symplocos nokoensis (Hayata) Kanehira (受到威脅)
- 佐佐木氏灰木 Symplocos sasakii Hayata (受到威脅)
- 希蘭灰木 Symplocos shilanensis Y. C. Liu & F. Y. Lu (受到威脅)
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百合科 Liliaceae
- 玉山蒜 Allium morrisonense Hayata (特有種)
- 台灣蜘蛛抱蛋 Aspidistra elatior Blume var. attenuata (Hay.) S.S.Ying (特有種)
- 阿里山假寶鐸花 Disporopsis arisanensis Hayata (特有種)
- 台灣假寶鐸花 Disporopsis taiwanensis S.S.Ying (特有種)
- 台灣寶鐸花 Disporum cantoniense (Lour.) Merr. var. kawakamii (Hayata) H. Hara (特有種)
- 南投寶鐸花 Disporum nantouense S. S. Ying (特有種)
- 山寶鐸花 Disporum sessile D. Don ex Schultes var. shimadai (Hayata) H. Hara (特有種)
- 台灣胡麻花 Helonias umbellata Baker (疑問種)
- 台灣百合 Lilium longiflorum Thunb. var. formosanum Baker (特有種)
- 粗莖麝香百合 Lilium longiflorum Thunb. var. scabrum Masam. (特有種)
- 細葉麥門冬 Liriope graminifolia (L.) Baker (特有種)
- 台東七葉一枝花 Paris polyphylla Smith var. taitungensis (Ying) Ying (特有種)
- 高氏球子草 Peliosanthes kaoi Ohwi (特有種)
- 台灣黃精 Polygonatum altelobatum Hayata (稀有)
- 清水山黃精 Polygonatum chingshuishanianum S. S. Ying (疑問種)
- 萬年青 Rohdea japonica (Thunb.) Roth var. watanabei (Hay.) Ying (稀有)
- 台灣油點草 Tricyrtis formosana Baker (特有種)
- 毛果油點草 Tricyrtis lasiocarpa Matsumura (特有種)
- 卵葉油點草 Tricyrtis ovatifolia S. S. Ying (特有種)
- 鈴木氏油點草 Tricytis suzukii Masamune (受到威脅)
- 台灣藜蘆 Veratrum formosanum Loes. (特有種)
- 雪山黎蘆 Veratrum shueshanarum S. S. Ying (特有種)
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西番蓮科 Passifloraceae
- 假西番蓮 Adenia formosana Hayata (疑問種)
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夾竹桃科 Apocynaceae
- 蘭嶼念珠藤 Alyxia insularis Kanehira & Sasaki (特有種)
- 台灣念珠藤 Alyxia taiwanensis S. Y. Lu & Yuen P. Yang (特有種)
- 大錦蘭 Anodendron benthamiana Hemsl. (特有種)
- 台灣牛皮消 Cynanchum formosanum (Maxim.) Hemsl. ex Forbes & Hemsl. (特有種)
- 蘭嶼牛皮消 Cynanchum lanhsuense Yamazaki (疑問種)
- 風不動 Dischidia formosana Maxim. (特有種)
- 布朗藤 Heterostemma brownii Hayata (特有種)
- 山橙 Melodinus angustifolius Hayata (稀有)
- 台灣絡石 Trachelospermum formosanum Liu & Ou (特有種)
- 蘭嶼絡石 Trachelospermum lanyuense C. E. Chang (受到威脅)
- 疏花鷗蔓 Tylophora oshimae Hayata (疑問種)
- 台灣鷗蔓 Tylophora taiwanensis Hatusima (疑問種)
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忍冬科 Caprifoliaceae
- 台灣糯米條 Abelia chinensis R. Br. var. ionandra (Hayata) Masam. (稀有)
- 無梗忍冬 Lonicera apodantha Ohwi (特有種)
- 川上氏忍冬 Lonicera kawakamii (Hayata) Masam. (稀有)
- 追分忍冬 Lonicera oiwakensis Hayata (稀有)
- 玉山糯米樹 Viburnum integrifolium Hayata (特有種)
- 小葉莢蒾 Viburnum parvifolium Hayata (稀有)
- 台灣蝴蝶花 Viburnum plicatum Thunb. var. formosanum Y. C. Liu & C. H. Ou (稀有)
- 台東莢蒾 Viburnum taitoense Hayata (特有種)
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杜英科 Elaeocarpaceae
- 球果杜英 Elaeocarpus sphaericus (Gaertn.) Schumann var. hayatae (Kanehira & Sasaki) Chang (疑問種)
- 蘭嶼杜英 Elaeocarpus sylvestris (Lour.) Poir. var. lanyuensis (Chang) Chang (疑問種)
- 猴歡喜 Sloanea formosana Li (特有種)
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杜鵑花科 Ericaceae
- 銳葉南燭 Lyonia ovalifolia (Wall.) Drude var. lanceolata (Wall.) Hand.-Mazz. (特有種)
- 南澳杜鵑 Rhododendron breviperulatum Hayata (特有種)
- 棲蘭山杜鵑 Rhododendron chilanshanense Kurashige (疑問種)
- 台灣杜鵑 Rhododendron formosanum Hemsl. (特有種)
- 南湖杜鵑 Rhododendron hyperythrum Hayata (特有種)
- 烏來杜鵑 Rhododendron kanehirai Wilson (瀕臨絕滅)
- 著生杜鵑 Rhododendron kawakamii Hayata (稀有)
- 細葉杜鵑 Rhododendron noriakianum T. Suzuki (特有種)
- 金毛杜鵑 Rhododendron oldhamii Maxim. (特有種)
- 長卵葉馬銀花 Rhododendron ovatum Planch. var. lamprophyllum (Hayata) Y. C. Liu, F. Y. Lu & C. H. Ou (疑問種)
- 玉山杜鵑 Rhododendron pseudochrysanthum Hayata (特有種)
- 紅毛杜鵑 Rhododendron rubropilosum Hayata var. rubropilosum (特有種)
- 台灣高山杜鵑 Rhododendron rubropilosum Hayata var. taiwanalpinum (Ohwi) S. Y. Lu, (特有種)
- 凹葉越橘 Vaccinium emarginatum Hayata (特有種)
- 毛蕊花 Vaccinium japonicum Miq. var. lasiostemon Hayata (特有種)
- 鞍馬山越橘 Vaccinium kengii C. E. Chang (疑問種)
- 高山越橘 Vaccinium merrillianum Hayata (特有種)
- 巒大越橘 Vaccinium randaiense Hayata (特有種)
- 台灣大葉越橘 Vaccinium wrightii Gray var. formosanum (Hayata) H. L. Li (稀有)
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杉角豆車防使岩昆松芭芸虎金雨南柿柏
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杉科 Taxodiaceae
- 巒大杉 Cunninghamia konishii Hayata (稀有)
- 台灣杉 Taiwania cryptomerioides Hayata (疑問種)
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豆科 Fabaceae
- 黃花煉莢豆 Alysicarpus vaginalis (L.) DC. var. taiwanensis Ying (特有種)
- 台灣土圞兒 Apios taiwanianus Hosokawa (稀有)
- 南湖大山紫雲英 Astragalus nankotaizanensis Sasaki (瀕臨絕滅)
- 能高大山紫雲英 Astragalus nokoensis Sasaki (受到威脅)
- 澎湖決明 Cassia sophora L. var. penghuana Y. C. Liu & F. Y. Lu (疑問種)
- 鵝鑾鼻決明 Chamaecrista garambiensis (Hosok.) Ohashi (疑問種)
- 紅花假地藍 Crotalaria chiayiana Liu & Lu (特有種)
- 鵝鑾鼻野百合 Crotalaria similis Hemsl. (瀕臨絕滅)
- 雙節山螞蝗 Dendrolobium dispermum (Hay.) Schindl. (特有種)
- 疏花魚藤 Derris laxiflora Benth. (稀有)
- 細葉山螞蝗 Desmodium gracillium Hemsl. (受到威脅)
- 三裂葉扁豆 Dolichos trilobus L. var. kosyunensis (Hosokawa) Ohashi & Tateishi (受到威脅)
- 苗栗野豇豆 Dumasia miaoliensis Liu & Lu (受到威脅)
- 雜交野豇豆 Dumasia miaoliensis Y. C. Liu & F. Y. Lu × D. villosa DC. subsp. bicolor (Hayata) H. Ohashi & Tateishi (特有種)
- 台灣山黑扁豆 Dumasia villosa DC. subsp. bicolor (Hayata) Ohashi & Tateishi (特有種)
- 台灣鴨腱藤 Entada pursaetha DC. var. formosana (Kanehira) Ho (疑問種)
- 毛細花乳豆 Galactia tenuiflora (Klein ex Willd.) Wight & Arn. var. villosa (Wight & Arn.) Baker (特有種)
- 恆春皂莢 Gleditsia rolfei Vidal (受到威脅)
- 扁豆莢大豆 Glycine dolichocarpa Tateishi & Ohashi (稀有)
- 台灣大豆 Glycine max (L.) Merr. subsp. formosana (Hosokawa) Tateishi & Ohashi (稀有)
- 貓鼻頭木藍 Indigofera byobiensis Hosokawa (瀕臨絕滅)
- 腺葉木藍 Indigofera glandulifera Hay. (疑問種)
- 太魯閣木藍 Indigofera ramulosissima Hosokawa (瀕臨絕滅)
- 台灣木藍 Indigofera taiwaniana Huang & Wu (疑問種)
- 台灣馬鞍樹 Maackia taiwanensis Hoshi & Ohashi (受到威脅)
- 小葉魚藤 Millettia pulchra Kurz. var. microphylla Dunn (疑問種)
- 大血藤 Mucuna gigantea (Willd.) DC. subsp. tashiroi (Hay.) Ohashi & Tateish (瀕臨絕滅)
- 台灣紅豆樹 Ormosia formosana Kanehira (受到威脅)
- 恆春紅豆樹 Ormosia hengchuniana Huang (稀有)
- 台東葵草 Zornia intecta Mohlenb. (受到威脅)
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防己科 Menispermaceae
- 土防己 Cyclea gracillima Diels (特有種)
- 台灣土防己 Cyclea ochiaiana (Yamamoto) S. F. Huang & T. C. Huang (特有種)
- 恆春青牛膽 Tinospora dentata Diels (受到威脅)
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岩梅科 Diapensiaceae
- 李棟山裂緣花 Shortia rotundifolia (Maxim.) Makino var. ritoensis (Hayata) T. C. Huang & A. Hsiao (疑問種)
- 圓葉裂緣花 Shortia rotundifolia (Maxim.) Makino var. subcordata (Hayata) T. C. Huang & A. Hsiao (疑問種)
- 高山裂緣花 Shortia rotundifolia (Maxim.) Makino var. transalpina (Hayata) Yamazaki (疑問種)
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松科 Pinaceae
- 台灣冷杉 Abies kawakamii (Hayata) Ito (特有種)
- 台灣油杉 Keteleeria formosana Hayata (瀕臨絕滅)
- 台灣雲杉 Picea morrisonicola Hayata (特有種)
- 台灣華山松 Pinus mastersiana Hayata (特有種)
- 台灣五葉松 Pinus morrisonicola Hayata (特有種)
- 台灣二葉松 Pinus taiwanensis Hayata (特有種)
- 台灣黃杉 Pseudotsuga wilsoniana Hayata (稀有)
- 台灣鐵杉 Tsuga formosana Hayata (特有種)
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芭蕉科 Musaceae
- 台灣芭蕉 Musa formosana (Warb.) Hayata (特有種)
- 蘭嶼芭蕉 Musa insularimontana Hayata (瀕臨絕滅)
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芸香科 Rutaceae
- 南庄橙 Citrus taiwanica Tanaka & Shimada (疑問種)
- 山黃皮 Murraya euchrestifolia Hayata (特有種)
- 長果月橘 Murraya paniculata (L.) Jack. var. omphalocarpa (Hayata) Swingle (受到威脅)
- 台灣黃蘗 Phellodendron amurense Rupr. var. wilsonii (Hayata & Kanehira) Chang (稀有)
- 阿里山茵芋 Skimmia japonica Thunb. subsp. distincte-venulosa (Hayata) T. C. Ho var. distincte-venulosa (特有種)
- 台灣茵芋 Skimmia japonica Thunb.subsp.distincte-venulosa (Hayata) T. C. Ho var. orthoclada (Hayata) T. C. Ho, stat. nov. (特有種)
- 三葉花椒 Zanthoxylum pistaciiflorum Hayata (瀕臨絕滅)
- 屏東花椒 Zanthoxylum wutaiense Chen (受到威脅)
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虎皮楠科 Daphniphyllaceae
- 耿氏虎皮楠 Daphniphyllum glaucescens Bl. subsp. oldhamii (Hemsl.) Huang var. kengii (Hurusawa) Huang (特有種)
- 蘭嶼虎皮楠 Daphniphyllum glaucescens Bl. subsp. oldhamii (Hemsl.) Huang var. lanyuense Huang (特有種)
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虎耳草科 Saxifragaceae
- 落新婦 Astilbe longicarpa (Hayata) Hayata (特有種)
- 阿里山落新婦 Astilbe macroflora Hayata (特有種)
- 台灣草紫陽花 Cardiandra formosana Hayata (稀有)
- 大武貓兒眼睛草 Chrysosplenium hebetatum Ohwi (稀有)
- 台灣貓兒眼睛草 Chrysosplenium lanuginosum Hook. f. & Thoms. var. formosanum (Hayata) Hara (特有種)
- 心基葉溲疏 Deutzia cordatula Li (稀有)
- 台灣溲疏 Deutzia taiwanensis (Maxim.) Schneider (特有種)
- 高山藤繡球 Hydrangea aspera D. Don (特有種)
- 長葉繡球 Hydrangea longifolia Hayata (特有種)
- 小花鼠刺 Itea parviflora Hemsl. (特有種)
- 台灣嗩吶草 Mitella formosana (Hayata) Masam. (特有種)
- 台灣茶藨子 Ribes formosanum Hayata (特有種)
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金絲桃科 Clusiaceae
- 蘭嶼福木 Garcinia linii C. E. Chang (瀕臨絕滅)
- 台灣金絲桃 Hypericum formosanum Maxim. (稀有)
- 小雙花金絲桃 Hypericum geminiflorum Hemsl. var. simplicistylum (Hayata) Robson (特有種)
- 玉山金絲桃 Hypericum nagasawai Hayata (特有種)
- 清水金絲桃 Hypericum nakamurai (Masam.) Robson (受到威脅)
- 能高金絲桃 Hypericum nokoense Ohwi (疑問種)
- 方莖金絲桃 Hypericum subalatum Hayata (瀕臨絕滅)
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金縷梅科 Hamamelidaceae
- 台灣瑞木 Corylopsis stenopetala Hayata (受到威脅)
- 細葉蚊母樹 Distylium gracile Nakai (受到威脅)
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柿樹科 Ebenaceae
- 蘭嶼柿 Diospyros kotoensis Yamazaki (受到威脅)
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柏科 Cupressaceae
- 台灣肖楠 Calocedrus formosana (Florin) Florin (受到威脅)
- 紅檜 Chamaecyparis formosensis Matsum. (特有種)
- 台灣扁柏 Chamaecyparis taiwanensis Masam. & Suzuki (稀有)
- 清水圓柏 Juniperus chinensis L. var. tsukusiensis Masam. (瀕臨絕滅)
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柳流省秋紅胡茅苦茄香唇旅桔桑桃海
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柳葉菜科 Onagraceae
- 合歡柳葉菜 Epilobium hohuanense Ying ex Chen, Hoch & Raven (特有種)
- 南湖柳葉菜 Epilobium nankotaizanense Yamamoto (稀有)
- 彭氏柳葉菜 Epilobium pengii Chen, Hoch & Raven (稀有)
- 台灣柳葉菜 Epilobium taiwanianum Chen, Hoch & Raven (受到威脅)
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省沽油科 Staphyleaceae
- 山香圓 Turpinia formosana Nakai (特有種)
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秋海棠科 Begoniaceae
- 南台灣秋海棠 Begonia austrotaiwanensis Chen & Peng (稀有)
- 武威山秋海棠 Begonia buimontana Yamamoto (特有種)
- 溪頭秋海棠 Begonia chitoensis Liu & Lai (特有種)
- 白斑水鴨腳 Begonia formosana (Hayata) Masamune forma albomaculata Liu & Lai (特有種)
- 鹿谷秋海棠 Begonia lukuana Liu & Ou (稀有)
- 南投秋海棠 Begonia nantoensis Lai & Chung (特有種)
- 岩生秋海棠 Begonia ravenii Peng & Chen (稀有)
- 台北秋海棠 Begonia × taipeiensis C. I Peng (特有種)
- 台灣秋海棠 Begonia taiwaniana Hayata (特有種)
- 太魯閣秋海棠 Begonia tarokoensis Lai (特有種)
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胡椒科 Piperaceae
- 山椒草 Peperomia nakaharai Hayata (特有種)
- 紅莖椒草 Peperomia sui T. T. Lin & S. Y. Lu (疑問種)
- 恒春風藤 Piper kawakamii Hayata (特有種)
- 綠島風藤 Piper kwashoense Hayata 併入菲律賓胡椒 (受到威脅)
- 薄葉風藤 Piper sintenense Hatusima (特有種)
- 台灣荖藤 Piper taiwanense Lin & Lu (特有種)
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胡頹子科 Elaeagnaceae
- 台灣胡頹子 Elaeagnus formosana Nakai (特有種)
- 蓬萊胡頹子 Elaeagnus formosensis Hatusima (特有種)
- 慈恩胡頹子 Elaeagnus grandifolia Hayata (特有種)
- 大橋胡頹子 Elaeagnus ohashii T. C. Huang (受到威脅)
- 太魯閣胡頹子 Elaeagnus tarokoensis Lu & Yang (受到威脅)
- 鄧氏胡頹子 Elaeagnus thunbergii Serv. (特有種)
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苦木科 Simaroubaceae
- 臭椿 Ailanthus altissima (Miller) Swingle var. tanakai (Hayata) Sasaki (稀有)
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苦苣苔科 Gesneriaceae
- 台灣苣苔 Epithema taiwanensis S. S. Ying var. taiwanensis (受到威脅)
- 蘭嶼石吊蘭 Lysionotus pauciflorus Maxim. var. ikedae (Hatusima) W. T. Wang (瀕臨絕滅)
- 短梗同蕊草 Rhynchotechum brevipedunculatum J. C. Wang (特有種)
- 玉玲花 Whytockia sasakii (Hayata) Burtt (稀有)
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茄科 Solanaceae
- 白狗大山茄 Solanum peikuoensis S. S. Ying (特有種)
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唇形科 Labiatae
- 疏花風輪菜 Clinopodium laxiflorum (Hayata) Mori var. laxiflorum (特有種)
- 台灣風輪菜 Clinopodium laxiflorum (Hayata) Mori var. taiwanianum T. H. Hsieh & T. C. Huang (受到威脅)
- 台灣白木草 Comanthosphace formosana Ohwi (受到威脅)
- 台灣錐花 Gomphostemma callicarpoides (Yamamoto) Masam. (稀有)
- 大苞偏穗花 Keiskea macrobracteata Masam. (受到威脅)
- 台灣假糙蘇 Paraphlomis formosana (Hayata) T. H. Hsieh & T. C. Huang (稀有)
- 絨萼舞子草 Paraphlomis tomentoso-capitata Yamamoto (稀有)
- 台灣刺蕊草 Pogostemon formosanus Oliv. (稀有)
- 高山夏枯草 Prunella vulgaris L. var. nanhutashanense S. S. Ying (疑問種)
- 阿里山紫花鼠尾草 Salvia arisanensis Hayata (疑問種)
- 台灣紫花鼠尾草 Salvia formosana (Murata) Yamazaki var. formosana (疑問種)
- 蕨葉紫花鼠尾草 Salvia formosana (Murata) Yamazaki var. matsudae (Kudo) T. C. Huang & J. T. Wu (疑問種)
- 早田氏鼠尾草 Salvia hayatana Makino ex Hayata (稀有)
- 隱藥鼠尾草 Salvia keitaoensis Hayata (疑問種)
- 黃花鼠尾草 Salvia nipponica Miq. var. formosana (Hayata) Kudo (稀有)
- 南台灣黃芩 Scutellaria austrotaiwanensis T. H. Hsieh & T. C. Huang (疑問種)
- 布烈氏黃芩 Scutellaria playfairii Kudo (特有種)
- 台灣黃芩 Scutellaria taiwanensis C. Y. Wu (疑問種)
- 田代氏黃芩 Scutellaria tashiroi Hayata (稀有)
- 鈴木草 Suzukia shikikunensis Kudo (稀有)
- 台灣香科科 Teucrium taiwanianum T.H. Hsieh & T.C. Huang (疑問種)
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桔梗科 Campanulaceae
- 玉山沙參 Adenophora morrisonensis Hayata subsp. morrisonensis (特有種)
- 高山沙參 Adenophora morrisonensis Hayata subsp. uehatae (Yamamoto) Lammers (特有種)
- 玉山山奶草 Codonopsis kawakamii Hayata (特有種)
- 大本山梗菜 Lobelia seguinii H. Lév. & Vant. (特有種)
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桑科 Moraceae
- 鵝鑾鼻藤榕 Ficus microcarpa L. f. var. oluangpiensis Liao (疑問種)
- 愛玉子 Ficus pumila L. var. awkeotsang (Makino) Corner (特有種)
- 蘭嶼落葉榕 Ficus ruficaulis Merr. var. antaoensis (Hayata) Hatus. & J. C. Liao (疑問種)
- 濱榕 Ficus tannoensis Hayata (特有種)
- 越橘葉蔓榕 Ficus vaccinioides Hemsl. ex King (特有種)
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桑寄生科 Loranthaceae
- 高氏桑寄生 Loranthus kaoi (Chao) Kiu (稀有)
- 忍冬葉桑寄生 Scurrula lonicerifolia (Hayata) Danser (特有種)
- 恆春桑寄生 Scurrula pseudochinensis (Yamamoto) Y. C. Liu & K. L. Chen (稀有)
- 杜鵑桑寄生 Scurrula rhododendricola (Hayata) Danser (特有種)
- 李棟山桑寄生 Scurrula ritozanensis (Hayata) Danser (特有種)
- 蓮華池寄生 Scurrula tsaii (Chiu) Yang and Lu (稀有)
- 松寄生 Taxillus matsudae (Hayata) Danser (特有種)
- 台灣槲寄生 Viscum alniformosanae Hayata (特有種)
- 刀葉槲寄生 Viscum multinerve (Hayata) Hayata (受到威脅)
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桃金孃科 Myrtaceae
- 密脈赤楠 Syzygium densinervium Merr. var. insulare Chang (受到威脅)
- 細脈赤楠 Syzygium euphlebium (Hayata) Mori (特有種)
- 台灣赤楠 Syzygium formosanum (Hayata) Mori (特有種)
- 高士佛赤楠 Syzygium kusukusense (Hayata) Mori (稀有)
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海桐科 Pittosporaceae
- 大葉海桐 Pittosporum daphniphylloides Hayata (特有種)
- 細葉疏果海桐 Pittosporum illicioides Makino var. angustifolium Huang ex Lu (受到威脅)
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浮狸草茶茨馬珙茜商密敗旋旌梧清眼
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茶科 Theaceae
- 台灣楊桐 Adinandra formosana Hayata (特有種)
- 毛柱楊桐 Adinandra lasiostyla Hayata (特有種)
- 細葉茶梨 Anneslea lanceolata (Hayata) Kanehira (受到威脅)
- 武威山茶 Camellia buisanensis Sasaki (疑問種)
- 恆春山茶 Camellia hengchunensis Chang (瀕臨絕滅)
- 能高山茶 Camellia nokoensis Hayata (特有種)
- 台灣山茶 Camellia sinensis (L.) Ktze. f. formosensis Kitam. (特有種)
- 細葉山茶 Camellia tenuifolia (Hayata) Coh-Stuart (特有種)
- 阿里山茶 Camellia transarisanensis (Hayata) Coh-Stuart (特有種)
- 泛能高山茶 Camellia transnokoensis Hayata (特有種)
- 長果紅淡比 Cleyera japonica Thunb. var. longicarpa (Yamamoto) Ling & Hsieh (特有種)
- 森氏紅淡比 Cleyera japonica Thunb. var. morii (Yamamoto) Masam. (特有種)
- 太平紅淡比 Cleyera japonica Thunb. var. taipinensis Keng (特有種)
- 假柃木 Eurya crenatifolia (Yamamoto) Kobuski (特有種)
- 厚葉柃木 Eurya glaberrima Hayata var. glaberrima (特有種)
- 清水山柃木 Eurya glaberrima Hayata var. taitungensis (Chang) Y. P. Yang & S. Z. Yang (疑問種)
- 薄葉柃木 Eurya leptophylla Hayata (特有種)
- 南仁山柃木 Eurya nanjenshanensis (Hsieh, Ling & Yang) S. Z.Yang & S.Y. Lu (稀有)
- 蓮華池柃木 Eurya rengechiensis Yamamoto (受到威脅)
- 粗毛柃木 Eurya strigillosa Hayata (特有種)
- 港口木荷 Schima superba Gard. & Champ. var. kankaoensis (Hayata) Keng (特有種)
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馬兜鈴科 Aristolochiaceae
- 瓜葉馬兜鈴 Aristolochia cucurbitifolia Hayata (特有種)
- 鴛鴦湖細辛 Asarum crassusepalum S. F. Huang, T. H. Hsieh & T. C. Huang (疑問種)
- 上花細辛 Asarum epigynum Hayata (特有種)
- 大花細辛 Asarum macranthum Hook. f. (受到威脅)
- 太平山細辛 Asarum taipingshanianum S. F. Huang, T. H. Hsieh & T. C. Huang (特有種)
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馬鞭草科 Verbenaceae
- 六龜粗糠樹 Callicarpa formosana Rolfe var. glabrata T. T. Chen, S. M. Chaw & Yuen P. Yang (特有種)
- 長葉杜虹花 Callicarpa formosana Rolfe var. longifolia Suzuki (特有種)
- 灰背葉紫珠 Callicarpa hypoleucophylla W. F. Lin & I. L. Wang (受到威脅)
- 細葉紫珠 Callicarpa pilosissima Maxim. (特有種)
- 巒大紫珠 Callicarpa randaiensis Hayata (特有種)
- 疏花紫珠 Callicarpa remotiflora Lin & Wang (稀有)
- 疏齒紫珠 Callicarpa remotiserrulata Hayata (稀有)
- 銳葉紫珠 Callicarpa tikusikensis Masam. (特有種)
- 花蓮海州常山 Clerodendrum ohwi Kanehira & Hatusima. (疑問種)
- 恆春臭黃荊 Premna hengchunensis S. Y. Lu & Yuen P. Yang (疑問種)
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茜草科 Rubiaceae
- 無刺伏牛花 Damnacanthus angustifolius Hayata (特有種)
- 刺果豬殃殃 Galium echinocarpum Hayata (特有種)
- 圓葉豬殃殃 Galium formosense Ohwi (特有種)
- 福山氏豬殃殃 Galium fukuyamai Masam. (受到威脅)
- 森氏豬殃殃 Galium morii Hayata (稀有)
- 南湖大山豬殃殃 Galium nankotaizanum Ohwi (稀有)
- 台灣豬殃殃 Galium taiwanense Masam. (稀有)
- 太魯閣豬殃殃 Galium tarokoense Hayata (稀有)
- 臭涼喉茶 Hedyotis butensis Masam. (疑問種)
- 密毛雞屎樹 Lasianthus appressihirtus Simizu var. appressihirtus (特有種)
- 薄葉雞屎樹 Lasianthus microstachys Hayata (特有種)
- 清水氏雞屎樹 Lasianthus obliquinervis Merr. var. simizui T. S. Liu & J. M. Chao (疑問種)
- 台東雞屎樹 Lasianthus obliquinervis Merr. var. taitoensis (Simizu) T. S. Liu & J. M. Chao (特有種)
- 早田氏蛇根草 Ophiorrhiza hayatana Ohwi (特有種)
- 玉蘭草 Ophiorrhiza michelloides (Masamune) Lo (特有種)
- 直立紅藤草 Rubia akane Nakai var. erecta Masamune (特有種)
- 金劍草 Rubia lanceolata Hayata (特有種)
- 林氏茜草 Rubia linii Chao (特有種)
- 薄葉玉心花 Tarenna gracilipes (Hayata) Ohwi (特有種)
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敗醬科 Valerianaceae
- 禿敗醬 Patrinia glabrifolia Yamamoto & Sasaki (特有種)
- 高山纈草 Valeriana kawakamii Hayata (特有種)
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旋花科 Convolvulaceae
- 鈍葉朝顏 Argyreia formosana Ishigami ex Yamazaki (稀有)
- 台灣菟絲子 Cuscuta japonica Choisy var. formosana (Hayata) Yunck. (特有種)
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梧桐科 Sterculiaceae
- 台灣梭羅樹 Reevesia formosana Sprague (特有種)
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清風藤科 Sabiaceae
- 紫珠葉泡花 Meliosma callicarpifolia Hayata (稀有)
- 阿里山清風藤 Sabia transarisanensis Hayata (特有種)
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莎莧蛇野鹿牻報景棕殼無番粟紫菱菊
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莎草科 Cyperaceae
- 垂穗薹 Carex brachyathera Ohwi (特有種)
- 茶色扁果薹 Carex fulvorubescens Hayata (稀有)
- 劉氏薹 Carex liuii T. Koyama & Chuang (稀有)
- 夢佳宿柱薹 Carex manca Boott subsp. takasagoana (Akiyama) T. Koyama (稀有)
- 森氏薹 Carex morii Hayata (受到威脅)
- 直蕊宿柱薹 Carex orthostemon Hayata (稀有)
- 太魯閣薹 Carex purpureotincta Ohwi (瀕臨絕滅)
- 台灣疏花薹 Carex taiwanensis (Ohwi) Akiyama (稀有)
- 扁果薹 Carex urelytra Ohwi (稀有)
- 台南飄拂草 Fimbristylis microcarya F. Muell. var. tainanensis (Ohwi) H. Y. Liu (稀有)
- 白穗飄拂草 Fimbristylis shimadana Ohwi (瀕臨絕滅)
- 知本飄拂草 Fimbristylis subinclinata T. Koyama (瀕臨絕滅)
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莧科 Amaranthaceae
- 台東青葙 Celosia taitoensis Hayata (疑問種)
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野牡丹科 Melastomataceae
- 大野牡丹 Astronia ferruginea Elmer (稀有)
- 小金石榴 Bredia gibba Ohwi (特有種)
- 金石榴 Bredia oldhamii Hooker f. (特有種)
- 圓葉布勒德藤 Bredia rotundifolia Y. C. Liu & C. H.Ou (稀有)
- 台灣野牡丹藤 Medinilla formosana Hayata (受到威脅)
- 蘭嶼野牡丹藤 Medinilla hayataina Keng (瀕臨絕滅)
- 台灣厚距花 Medinilla taiwaniana Y. P. Yang & H. Y. Liu (特有種)
- 糙葉耳藥花 Melastoma scaberrima (Hayata) Y. P. Yang & H. Y. Lin (特有種)
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鹿蹄草科 Pyrolaceae
- 斑紋鹿蹄草 Pyrola albo-reticulata Hayata (特有種)
- 玉山鹿蹄草 Pyrola morrisonensis (Hayata) Hayata (特有種)
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牻牛兒苗科 Geraniaceae
- 單花牻牛兒苗 Geranium hayatanum Ohwi (特有種)
- 山牻牛兒苗 Geranium suzukii Masam. (特有種)
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報春花科 Primulaceae
- 台灣排香 Lysimachia ardisioides Masam. (特有種)
- 清水山過路黃 Lysimachia chingshuiensis C.-I Peng & C. M. Hu (瀕臨絕滅)
- 黑點珍珠菜 Lysimachia nigropunctata Masam. (特有種)
- 玉山櫻草 Primula miyabeana Ito & Kawakami (特有種)
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景天科 Crassulaceae
- 鵝鑾鼻燈籠草 Kalanchoe garambiensis Kudo (特有種)
- 小燈籠草 Kalanchoe gracilis Hance (特有種)
- 星果佛甲草 Sedum actinocarpum Yamamoto (特有種)
- 杉葉佛甲草 Sedum cryptomerioides Bart. & Yamamoto (特有種)
- 紅子佛甲草 Sedum erythrospermum Hayata (特有種)
- 小萼佛甲草 Sedum microsepalum Hayata (稀有)
- 玉山佛甲草 Sedum morrisonense Hayata (特有種)
- 能高佛甲草 Sedum nokoense Yamamoto (特有種)
- 尖萼佛甲草 Sedum parvisepalum Yamamoto (特有種)
- 石碇佛甲草 Sedum sekiteiense Yamamoto (受到威脅)
- 穗花八寶 Sedum subcapitatum Hayata (稀有)
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棕櫚科 Arecaceae
- 台灣水藤 Calamus formosanus Becc. (特有種)
- 黃藤 Calamus quiquesetinervius Burret (特有種)
- 山檳榔 Pinanga tashiroi Hayata (瀕臨絕滅)
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殼斗科 Fagaceae
- 單刺苦櫧 Castanopsis carlesii (Hemsl.) Hayata var. sessilis Nakai 併入長尾尖葉櫧 (疑問種)
- 細刺苦櫧 Castanopsis kusanoi Hayata (特有種)
- 谷園青剛櫟 Cyclobalanopsis glauca (Thunb.) Oerst. var. kuyuensis (Liao) Liao (特有種)
- 佳保臺圓果青剛櫟 Cyclobalanopsis globosa Lin & Liu forma. chiapautaiensis (Liao) Liao (特有種)
- 鬼石櫟 Lithocarpus castanopsisifolius (Hayata) Hayata (特有種)
- 柳葉石櫟 Lithocarpus dodoniifolius (Hayata) Hayata (受到威脅)
- 台灣石櫟 Lithocarpus formosanus (Hayata) Hayata (受到威脅)
- 阿里山三斗石櫟 Lithocarpus hancei (Benth.) Rehd. (特有種)
- 三斗石櫟 Pasania hancei (Benth.) Schottky var. ternaticupula (Hayata) Liao (特有種)
- 細葉三斗石櫟 Pasania hancei (Benth.)Schott var. ternaticupula (Hay.)Liao forma subreticulata (Hay.)Liao (特有種)
- 大葉石櫟 Lithocarpus kawakamii (Hayata) Schottky (特有種)
- 油葉石櫟 Lithocarpus konishii (Hayata) Schottky (特有種)
- 南投石櫟 Lithocarpus nantoensis (Hayata) Schottky (受到威脅)
- 浸水營石櫟 Lithocarpus shinsuiensis (Hayata & Kanehira) Nakai (受到威脅)
- 灰背櫟 Quercus hypophaea (Hayata) Kudo (受到威脅)
- 錐果櫟 Quercus longinux Hayata (特有種)
- 郭氏錐果椆 Cyclobalanopsis hypophaea (Hayata) Kudo (特有種)
- 紫背錐果櫟 Cyclobalanopsis longinux (Hayata) Schott. var. lativiolaciifolia Liao (特有種)
- 赤柯 Quercus morii Hayata (特有種)
- 波葉櫟 Quercus rapandifolia Liao (瀕臨絕滅)
- 狹葉櫟 Quercus stenophylloides Hayata (特有種)
- 太魯閣櫟 Quercus tarokoensis Hayata (特有種)
- 銳葉高山櫟 Quercus tatakaensis Tomiya (特有種)
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無患子科 Sapindaceae
- 台灣欒樹 Koelreuteria henryi Dummer (特有種)
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紫金牛科 Myrsinaceae
- 雨傘仔 Ardisia cornudentata Mez subsp. cornudentata (特有種)
- 玉山紫金牛 Ardisia cornudentata Mez subsp. morrisonensis (Hayata) Yang var. morrisonensis (特有種)
- 阿里山紫金牛 Ardisia cornudentata Mez subsp. morrisonensis (Hayata) Yang var. stenosepala (Hayata) Yang (特有種)
- 高士佛紫金牛 Ardisia kusukuensis Hayata (受到威脅)
- 裡菫紫金牛 Ardisia violacea (T. Suzuki) W. Z. Fang & K Yao (疑問種)
- 藤毛木槲 Embelia laeta (L.) Mez var. papilligera (Nakai) Walker (特有種)
- 賽山椒 Embelia lenticellata Hayata (特有種)
- 蘭嶼山桂花 Maesa lanyuensis Yuen P.Yang (疑問種)
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紫草科 Boraginaceae
- 高山倒提壺 Cynoglossum alpestre Ohwi (受到威脅)
- 山豆根 Heliotropium formosanum I. M. Johnst. (特有種)
- 台灣附地草 Trigonotis formosana Hayata var. formosana (特有種)
- 台北附地草 Trigonotis formosana Hayata var. elevatovenosa (Hayata) S. D. Shen & J. C. Wang (特有種)
- 南湖附地草 Trigonotis nankotaizanensis (Sasaki) Masam. & Ohwi ex Masam. (受到威脅)
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紫菫科 Fumariaceae
- 凹子黃菫 Corydalis pallida (Thunb.) Pers. var. sparsimamma (Ohwi) Ohwi 併入黃菫 (特有種)
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菱科 Trapaceae
- 台灣菱 Trapa bicornis Osbeck var. taiwanensis (Nakai) Xiong (特有種)
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菊科 Asteraceae
- 中原氏鬼督郵 Ainsliaea secundiflora Hayata (受到威脅)
- 蓬萊籟簫 Anaphalis horaimontana Masam. (疑問種)
- 山艾 Artemisia kawakamii Hayata (特有種)
- 細葉山艾 Artemisia morrisonensis Hayata (特有種)
- 玉山艾 Artemisia niitakayamensis Hayata (受到威脅)
- 高山艾 Artemisia oligocarpa Hayata (特有種)
- 太魯閣艾 Artemisia somai Hayata var. batakensis (Hayata) Kitam. (疑問種)
- 相馬氏艾 Artemisia somai Hayata var. somai (特有種)
- 雪山艾 Artemisia tsugitakaensis (Kitam.) Ling & Y. R. Ling (疑問種)
- 清水馬蘭 Aster chingshuiensis Y. C. Liu & C. H. Ou (受到威脅)
- 台灣山白蘭 Aster formosanus Hayata (特有種)
- 大武山紫菀 Aster itsunboshi Kitam. (疑問種)
- 玉山鐵桿蒿 Aster morrisonensis Hayata (瀕臨絕滅)
- 台灣狗娃花 Aster oldhamii Hemsl. (特有種)
- 台灣紺菊 Aster ovalifolius Kitam. (瀕臨絕滅)
- 台灣馬蘭 Aster taiwanensis Kitam. (特有種)
- 雪山馬蘭 Aster takasagomontanus Sasaki (受到威脅)
- 桃園馬蘭 Aster taoyuenensis S. S. Ying (瀕臨絕滅)
- 狹葉艾納香 Blumea linearis C.-I Peng & W. P. Leu (稀有)
- 阿里山薊 Cirsium arisanense Kitam. (特有種)
- 鱗毛薊 Cirsium ferum Kitam. (特有種)
- 細川氏薊 Cirsium hosokawae Kitam. (特有種)
- 白花小薊 Cirsium japonicum DC. var. takaoense Kitam. (受到威脅)
- 玉山薊 Cirsium kawakamii Hayata (特有種)
- 森氏薊 Cirsium morii Hayata (受到威脅)
- 鈴木氏薊 Cirsium suzukii Kitam. (稀有)
- 台灣假黃鵪菜 Crepidiastrum taiwanianum Nakai (瀕臨絕滅)
- 阿里山油菊 Dendranthema arisanense (Hayata) Y. Ling & C. Shih (特有種)
- 蓬萊油菊 Dendranthema horaimontana (Masam.) S. S. Ying (瀕臨絕滅)
- 森氏菊 Dendranthema morii (Hayata) Kitam. (受到威脅)
- 福山氏飛蓬 Erigeron morrisonensis Hayata var. fukuyamae (Kitam. ) Kitam. (特有種)
- 玉山飛蓬 Erigeron morrisonensis Hayata var. morrisonensis (特有種)
- 腺葉澤蘭 Eupatorium amabile Kitam. (特有種)
- 塔山澤蘭 Eupatorium chinense L. var. tozanense (Hayata) Kitam. (特有種)
- 高士佛澤蘭 Eupatorium clematideum (Wall. ex DC.) Sch. Bip. var. gracillimum (Hayata) C.-I Peng & S. W. Chung (受到威脅)
- 花蓮澤蘭 Eupatorium hualienense C. H. Ou, S. W. Chung and C. -I peng (特有種)
- 基隆澤蘭 Eupatorium kiirunense (Kitam.) C. H. Ou & S. W. Chung (特有種)
- 島田氏澤蘭 Eupatorium shimadai Kitam. (特有種)
- 白鳳菜 Gynura divaricata (L.) DC. subsp. formosana (Kitam.) F. G. Davies (特有種)
- 蘭嶼木耳菜 Gynura elliptica Yabe & Hayata (受到威脅)
- 森氏山柳菊 Hieracium morii Hayata (稀有)
- 能高刀傷草 Ixeridium transnokoense (Y. Sasaki) J. H. Pak & Kawano (特有種)
- 台灣稻槎草 Lapsanastrum takasei (Sasaki) J. H. Pak & K. Bremer (稀有)
- 玉山薄雪草 Leontopodium microphyllum Hayata (特有種)
- 高山橐吾 Ligularia kojimae Kitam. (受到威脅)
- 台灣劉寄奴 Nemosenecio formosanus (Kitam.) B. Nord (受到威脅)
- 台灣福王草 Notoseris formosana (Kitam.) C. Shih (特有種)
- 玉山蟹甲草 Parasenecio monantha (Diels) C.-I Peng & S. W. Chung (特有種)
- 能高蟹甲草 Parasenecio nokoensis ( Masam. & Suzuki) C.-I Peng & S. W. Chung (瀕臨絕滅)
- 半高野帚 Pertya simozawai Masam. (瀕臨絕滅)
- 台灣款冬 Petasites formosanus Kitam. (特有種)
- 玉山毛連菜 Picris hieracioides L. subsp. morrisonensis (Hayata) Kitam. (特有種)
- 高山毛連菜 Picris hieracioides L. subsp. ohwiana (Kitam. ) Kitam. (受到威脅)
- 恆春山苦藚 Pterocypsela × mansuensis (Hayata) C.-I Peng (特有種)
- 高山青木香 Saussurea glandulosa Kitam. (稀有)
- 關山青木香 Saussurea kanzanensis Kitam. (受到威脅)
- 奇萊青木香 Saussurea kiraisanensis Masam. (瀕臨絕滅)
- 小蔓黃菀 Senecio crataegifolius Hayata (稀有)
- 玉山黃菀 Senecio morrisonensis Hayata (特有種)
- 黃菀 Senecio nemorensis L. var. dentatus (Kitam.) H. Koyama (特有種)
- 台東黃菀 Senecio taitungensis S. S. Ying (特有種)
- 太魯閣千里光 Senecio tarokoensis C.-I Peng (瀕臨絕滅)
- 台灣破傘菊 Syneilesis intermedia (Hayata) Acta Phytotax. (瀕臨絕滅)
- 高山破傘菊 Syneilesis subglabrata (Yamam. & Sasaki) Kitam. (受到威脅)
- 台灣狗舌草 Tephroseris taitoensis (Hayata) Holub (瀕臨絕滅)
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黃菫菝菖酢楊楓榆楝溝瑞落葫葡鼠漆
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黃楊科 Buxaceae
- 琉球黃楊 Buxus liukiuensis Makino (特有種)
- 太魯閣黃楊 Buxus microphylla Sieb. & Zucc. subsp. sinica (Rehd. & Wils.) Hatusima var. tarokoensis Lu & Yang (疑問種)
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菫菜科 Violaceae
- 喜岩菫菜 Viola adenothrix Hayata var. adenothrix (特有種)
- 雪山菫菜 Viola adenothrix Hayata var. tsugitakaensis (Masam.) Wang & Huang (特有種)
- 台灣菫菜 Viola formosana Hayata var. formosana (特有種)
- 川上氏菫菜 Viola formosana Hayata var. stenopetala (Hayata) Wang, Huang & Hashi (特有種)
- 台北菫菜 Viola nagasawai Makino & Hayata var. nagasawai (特有種)
- 普萊氏菫菜 Viola nagasawai Makino & Hayata var. pricei (W. Becker) Wang & Huang (特有種)
- 翠峰菫菜 Viola obtusa (Makino) Makino var. tsuifengensis Hashimoto (疑問種)
- 尖山菫菜 Viola senzanensis Hayata (特有種)
- 新竹菫菜 Viola shinchikuensis Yamamoto (特有種)
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菝葜科 Smilacaceae
- 台中假土茯苓 Heterosmilax seisuiensis (Hayata) F. T. Wang & T. Tang (疑問種)
- 早田氏菝葜 Smilax hayatae T. Koyama (特有種)
- 密刺菝葜 Smilax horridiramula Hayata (稀有)
- 呂氏菝葜 Smilax luei T. Koyama (瀕臨絕滅)
- 南投菝葜 Smilax nantoensis T. Koyama (稀有)
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酢醬草科 Oxalidaceae
- 大霸尖山酢漿草 Oxalis acetocella L. subsp. taemoni (Yamamoto) Huang & Huang (稀有)
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楊柳科 Salicaceae
- 薄葉柳 Salix fulvopubescens Hayata var. doii (Hayata) Yang & Huang (特有種)
- 褐毛柳 Salix fulvopubescens Hayata var. fulvopubescens (特有種)
- 白毛柳 Salix fulvopubescens Hayata var. tagawana (Koidz.) Yang & Huang (特有種)
- 水社柳 Salix kusanoi (Hayata) Schneider (稀有)
- 關山嶺柳 Salix okamotoana Koidz. (瀕臨絕滅)
- 玉山柳 Salix taiwanalpina Kimura var. morrisonicola (Kimura) Yang & Huang (稀有)
- 高山柳 Salix taiwanalpina Kimura var. takasagoalpina (Koidz.) Ying (稀有)
- 台灣山柳 Salix taiwanalpina Kimura var. taiwanalpina (稀有)
- 水柳 Salix warburgii O. Seemen (特有種)
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楓樹科 Aceraceae
- 樟葉槭 Acer albopurpurascens Hayata (特有種)
- 台灣三角楓 Acer buergerianum Miq var. formosanum (Hayata) Sasaki (瀕臨絕滅)
- 川上氏槭 Acer insulare Makino var. caudatifolium (Hayata) S. Y. Lu & Y. P. Yang 川上氏楓 尖葉槭(特有種)
- 台灣掌葉槭 Acer palmatum Thunb. var. pubescens Li (稀有)
- 台灣紅榨槭 Acer rubescens Hayata (特有種)
- 青楓 Acer serrulatum Hayata (特有種)
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榆科 Ulmaceae
- 石朴 Celtis formosana Hayata (特有種)
- 小葉朴 Celtis nervosa Hemsl. (稀有)
- 阿里山榆 Ulmus uyematsui Hayata (特有種)
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瑞香科 Thymelaeaceae
- 台灣瑞香 Daphne arisanensis Hayata (特有種)
- 白花瑞香 Daphne kiusiana Miq. var. atrocaulis (Rehder) Maekawa (特有種)
- 玉山瑞香 Daphne morrisonesis Chang (疑問種)
- 矮瑞香 Stellera formosana (Hayata) Li 併入玉山瑞香 (稀有)
- 紅蕘花 Wikstroemia mononectaria Hayata (疑問種)
- 台灣蕘花 Wikstroemia taiwanensis Chang (受到威脅)
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葫蘆科 Cucurbitaceae
- 台灣羅漢果 Siraitia taiwaniana (Hayata) C. Jeffrey ex Lu & Zhang (稀有)
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葡萄科 Vitaceae
- 蘭嶼粉藤 Cissus lanyuensis (Chang) F. Y. Lu (受到威脅)
- 翼莖粉藤 Cissus pteroclada Hayata (疑問種)
- 翼柄崖爬藤 Tetrastigma alatum Li (特有種)
- 三角鱉草 Tetrastigma dentatum (Hayata) Li (特有種)
- 台灣崖爬藤 Tetrastigma umbellatum (Hemsl.) Nakai (特有種)
- 基隆葡萄 Vitis kelungensis Moriyama (特有種)
- 小葉葡萄 Vitis thunbergii Sieb. & Zucc. var. taiwaniana Lu (特有種)
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鼠李科 Rhamnaceae
- 阿里山黃鱔藤 Berchemia arisanensis Liu & Lu (疑問種)
- 奮起湖黃鱔藤 Berchemia fenchifuensis Wang & Lu (特有種)
- 清水鼠李 Rhamnus chingshuiensis Shimizu var. chingshuiensis (疑問種)
- 塔山鼠李 Rhamnus chingshuiensis Shimizu var. tashanensis Liu & Wang (特有種)
- 桶鉤藤 Rhamnus formosana Matsum. (特有種)
- 中原氏鼠李 Rhamnus nakaharae (Hayata) Hayata (特有種)
- 畢祿山鼠李 Rhamnus pilushanensis Liu & Wang (特有種)
- 巒大雀梅藤 Sageretia randaiensis Hayata (特有種)
- 翼核木 Ventilago elegans Hemsl. (特有種)
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睡遠銀鳶鳳蒺蓴樟穀蓮蔥衛霉蔜蓼曇
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睡菜科 Menyanthaceae
- 龍潭莕菜 Nymphoides lungtanensis S. P. Li, T. H. Hsieh & C. C. Lin (疑問種)
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睡蓮科 Nymphaeaceae
- 台灣萍蓬草 Nuphar shimadai Hayata (瀕臨絕滅)
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遠志科 Polygalaceae
- 巨葉花遠志 Polygala arcuata Hayata (稀有)
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鳶尾科 Iridaceae
- 台灣射干 Belamcanda chinensis (L.) DC. var. taiwanensis Ying (疑問種)
- 台灣鳶尾 Iris formosana Ohwi (特有種)
- 南投鳶尾 Iris nantouensis Ying (特有種)
- 台灣射干 Belamcanda chinensis (L.) DC. var. taiwanensis Ying (受到威脅)
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鳳仙花科 Balsaminaceae
- 棣慕華鳳仙花 Impatiens devolii Huang (受到威脅)
- 黃花鳳仙花 Impatiens tayemonii Hayata (稀有)
- 紫花鳳仙花 Impatiens uniflora Hayata (特有種)
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樟科 Lauraceae
- 小葉樟 Cinnamomum brevipedunculatum C. E. Chang (稀有)
- 栳樹 Cinnamomum camphora (L.) Nees & Eberm. var. nominale Hayata 併入樟樹 (特有種)
- 台灣肉桂 Cinnamomum insulari-montanum Hayata (特有種)
- 牛樟 Cinnamomum kanehirae Hayata (稀有)
- 蘭嶼肉桂 Cinnamomum kotoense Kanehira & Sasaki (瀕臨絕滅)
- 胡氏肉桂 Cinnamomum macrostemon Hayata (疑問種)
- 土肉桂 Cinnamomum osmophloeum Kanehira (特有種)
- 土樟 Cinnamomum reticulatum Hayata (疑問種)
- 內苳子 Lindera akoensis Hayata (特有種)
- 屏東木薑子 Litsea akoensis Hayata (特有種)
- 竹頭角木薑子 Litsea akoensis Hayata var. chitouchiaoensis Liao 併入屏東木薑子 (疑問種)
- 狹葉木薑子 Litsea akoensis Hayata var. sasakii (Kamikoti) Liao 併入屏東木薑子 (疑問種)
- 黃肉樹 Litsea hypophaea Hayata (特有種)
- 李氏木薑子 Litsea lii Chang (稀有)
- 玉山木薑子 Litsea morrisonensis Hayata (特有種)
- 小西氏楠 Machilus konishii Hayata (特有種)
- 大葉楠 Machilus kusanoi Hayata (特有種)
- 恆春楨楠 Machilus obovatifolia (Hayata) Kanehira & Sasaki (受到威脅)
- 香楠 Machilus zuihoensis Hayata (特有種)
- 高山新木薑子 Neolitsea acuminatissima (Hayata) Kanehira & Sasaki (特有種)
- 石厝新木薑子 Neolitsea buisanensis Yamamoto & Kamikoti f. sutsuoensis J. C. Liao (特有種)
- 大武新木薑子 Neolitsea daibuensis Kamikoti (受到威脅)
- 南仁新木薑子 Neolitsea hiiranensis Liu & Liao (稀有)
- 小芽新木薑子 Neolitsea parvigemma (Hayata) Kanehira & Sasaki (稀有)
- 變葉新木薑子 Neolitsea variabilima (Hayata) Kanehira & Sasaki (特有種)
- 台灣檫樹 Sassafras randaiense (Hayata) Rehder (稀有)
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蔥草科 Xyridaceae
- 桃園草 Xyris formosana Hayata (瀕臨絕滅)
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衛矛科 Celastraceae
- 厚葉衛矛 Euonymus carnosus Hemsl. (特有種)
- 黃氏衛矛 Euonymus huangii H. Y. Liu & Y. P. Yang (玉山衛矛) (特有種)
- 淡綠葉衛矛 Euonymus pallidifolia Hayata (瀕臨絕滅)
- 刺果衛矛 Euonymus spraguei Hayata (特有種)
- 卵葉刺果衛矛 Euonymus trichocarpus Hayata (稀有)
- 佩羅特木 Perrottetia arisanensis Hayata (特有種)
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霉草科 Triuridaceae
- 多枝霉草 Sciaphila ramosa Fukuy. & T. Suzuki (瀕臨絕滅)
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蓼科 Polygonaceae
- 台灣何首烏 Polygonum multiflorum Thunb. ex Murray var. hypoleucum (Ohwi) Liu, Ying & Lai (特有種)
- 畢祿山蓼 Polygonum pilushanense Liu & Ou (特有種)
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樺澤燈錦鴨龍蕁檀爵穗薑薔薯檉藍雙鞭
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樺木科 Betulaceae
- 太魯閣千金榆 Carpinus hebestroma Yamamoto (疑問種)
- 蘭邯千金榆 Carpinus rankanensis Hayata (特有種)
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燈心草科 Juncaceae
- 大井氏燈心草 Juncus ohwianus M. T. Kao & DeVol (特有種)
- 玉山燈心草 Juncus triflorus Ohwi (特有種)
- 台灣地楊梅 Luzula taiwaniana Satake (特有種)
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錦葵科 Malvaceae
- 山芙蓉 Hibiscus taiwanensis Hu (特有種)
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鴨跖草科 Commelinaceae
- 川上氏鴨舌疝 Belosynapsis kawakamii (Hayata) C. I Peng & Y. J. Chen (稀有)
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龍膽科 Gentianaceae
- 阿里山龍膽 Gentiana arisanensis Hayata (特有種)
- 黃斑龍膽 Gentiana flavomaculata Hayata var. flavomaculata (特有種)
- 鴛鴦湖龍膽 Gentiana flavomaculata Hayata var. yuanyanghuensis C. H. Chen & J. C Wang (特有種)
- 高山龍膽 Gentiana horaimontana Masam. (受到威脅)
- 伊澤山龍膽 Gentiana itzershanensis T. S. Liu & Chiu C. Kuo (受到威脅)
- 高雄龍膽 Gentiana kaohsiungensis C. H. Chen & J. C. Wang (疑問種)
- 玉山龍膽 Gentiana scabrida Hayata var. scabrida (特有種)
- 黑斑龍膽 Gentiana scabrida Hayata var. punctulata S. S. Ying (特有種)
- 太魯閣龍膽 Gentiana tarokoensis C. H. Chen & J. C. Wang (瀕臨絕滅)
- 塔塔加龍膽 Gentiana tatakensis Masam. (受到威脅)
- 厚葉龍膽 Gentiana tentyoensis Masam. (瀕臨絕滅)
- 台東龍膽 Gentiana tenuissima Hayata (受到威脅)
- 奇萊肋柱花 Lomatogonium chilaiensis C. H. Chen & J. C. Wang (瀕臨絕滅)
- 阿里山當藥 Swertia arisanensis Hayata (稀有)
- 新店當藥 Swertia shintenensis Hayata (稀有)
- 高山當藥 Swertia tozanensis Hayata (特有種)
- 台北肺形草 Tripterospermum alutaceifolium (T. S. Liu & Chiu C. Kuo) J. Murata (特有種)
- 高山肺形草 Tripterospermum cordifolium (Yamamoto) Satake (特有種)
- 玉山肺形草 Tripterospermum lanceolatum (Hayata) Hara ex Satake (特有種)
- 小葉肺形草 Tripterospermum microphyllum H. Smith (稀有)
- 台灣肺形草 Tripterospermum taiwanense (Masam.) Satake (特有種)
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蕁麻科 Urticaceae
- 花蓮苧麻 Boehmeria hwaliensis Liu & Lu (疑問種)
- 畢祿山苧麻 Boehmeria pilushanensis Liu & Lu (特有種)
- 長葉苧麻 Boehmeria wattersii (Hance) Shih & Yang (特有種)
- 紅頭咬人狗 Dendrocnide kotoensis (Hayata ex Yamamoto) Shih & Yang (受到威脅)
- 銳齒樓梯草 Elatostema acuteserratum Shih & Yang (受到威脅)
- 糙梗樓梯草 Elatostema hirtellipedunculatum Shih & Yang (特有種)
- 白背樓梯草 Elatostema hypoglaucum Shih & Yang (特有種)
- 微頭花樓梯草 Elatostema microcephalanthum Hayata (特有種)
- 多溝樓梯草 Elatostema multicanaliculatum Shih & Yang (疑問種)
- 溪澗樓梯草 Elatostema rivulare Shih & Yang (特有種)
- 微粗毛樓梯草 Elatostema strigillosum Shih & Yang (疑問種)
- 近革葉樓梯草 Elatostema subcoriaceum Shih & Yang (特有種)
- 裂葉樓梯草 Elatostema trilobulatum (Hayata) Yamazaki (特有種)
- 柔毛樓梯草 Elatostema villosum Shih & Yang (疑問種)
- 小葉石薯 Gonostegia matsudai (Yamamoto ) Yamamoto & Masam. (特有種)
- 橢圓葉冷水麻 Pilea elliptifolia Shih & Yang (疑問種)
- 奮起湖冷水麻 Pilea funkikensis Hayata (特有種)
- 細尾冷水麻 Pilea matsudai Yamamoto (特有種)
- 圓果冷水麻 Pilea rotundinucula Hayata (特有種)
- 細葉冷水麻 Pilea somai Hayata (特有種)
- 台灣蕁麻 Urtica taiwaniana Ying (特有種)
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爵床科 Acanthaceae
- 銀脈爵床 Codonacanthus albo-nervosa (Hosok.) Yuen P. Yang (稀有)
- 大安水蓑衣 Hygrophila pogonocalyx Hayata (瀕臨絕滅)
- 早田氏爵床 Justicia procumbens L. var. hayatae (Yamamoto) Ohwi (受到威脅)
- 密毛爵床 Justicia procumbens L. var. hirsuta Yamamoto (受到威脅)
- 狹葉爵床 Justicia procumbens L. var. linearifolia Yamam. (受到威脅)
- 柳葉鱗球花 Lepidagathis stenophylla Clarke ex Hayata (受到威脅)
- 台灣明萼草 Rungia taiwanensis Yamazaki (特有種)
- 曲莖馬藍 Strobilanthes flexicaulis Hayata (特有種)
- 台灣馬藍 Strobilanthes formosanus Moore (特有種)
- 長穗馬藍 Strobilanthes longespicatus Hayata (特有種)
- 蘭崁馬藍 Strobilanthes rankanensis Hayata (特有種)
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穗花杉科 Amentotaxaceae
- 台灣穗花杉 Amentotaxus formosana H. L. Li (受到威脅)
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薑科 Zingiberaceae
- 川上氏月桃 Alpinia kawakamii Hayata (特有種)
- 屈尺月桃 Alpinia kusshakuensis Hayata (特有種)
- 角板山月桃 Alpinia mesanthera Hayata (特有種)
- 普來氏月桃 Alpinia pricei Hayata (特有種)
- 阿里山月桃 Alpinia sessiliflora Kitamura (特有種)
- 島田氏月桃 Alpinia shimadae Hayata (特有種)
- 屯鹿月桃 Alpinia tonrokuensis Hayata (特有種)
- 烏來月桃 Alpinia uraiensis Hayata (特有種)
- 蘭嶼法式薑 Vanoverberghia sasakiana H. Funak. & H. Ohashi (受到威脅)
- 三奈 Zingiber kawagoii Hayata (特有種)
- 少葉薑 Zingiber oligophyllum K. Schum. (疑問種)
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薔薇科 Rosaceae
- 台灣舖地蜈蚣 Cotoneaster konishii Hayata (特有種)
- 玉山舖地蜈蚣 Cotoneaster morrisonensis Hayata (特有種)
- 樂山舖地蜈蚣 Cotoneaster rokujodaisanensis Hayata (疑問種)
- 武威山枇杷 Eriobotrya deflexa (Hemsl.) Nakai f. buisanensis (Hayata) Nakai (特有種)
- 山枇杷 Eriobotrya deflexa (Hemsl.) Nakai f. deflexa (特有種)
- 台灣蚊子草 Filipendula kiraishiensis Hayata (稀有)
- 台灣草莓 Fragaria hayatai Makino (特有種)
- 台東石楠 Photinia ardisiifolia Hayata (稀有)
- 毛瓣石楠 Photinia lasiopetala Hayata (受到威脅)
- 高山飜白草 Potentilla matsumurae Th. Wolf. var. pilosa Koidz. (特有種)
- 雪山飜白草 Potentilla tugitakensis Masam. (稀有)
- 清水石楠 Pourthiaea chingshuiensis T. Shimizu (受到威脅)
- 台灣石楠 Pourthiaea lucida Decaisne (特有種)
- 小葉石楠 Pourthiaea villosa (Thunb. ex Murray) Decne. var. parvifolia (Pritz.) Iketani & Ohashi (特有種)
- 假皂莢 Prinsepia scandens Hayata (特有種)
- 太平山櫻花 Prunus matuurai Sasaki (特有種)
- 霧社山櫻花 Prunus taiwaniana Hayata (特有種)
- 山白櫻 Prunus takasagomontana Sasaki (受到威脅)
- 阿里山櫻花 Prunus transarisanensis Hayata (疑問種)
- 台灣火刺木 Pyracantha koidzumii (Hayata) Rehder (瀕臨絕滅)
- 台灣野梨 Pyrus taiwanensis Iketani & Ohashi (疑問種)
- 臺灣光葉薔薇 Rosa luciae Fr. & Rochebr. var. rosea Li (疑問種)
- 台灣野薔薇 Rosa multiflora Thunb. ex Murray var. formosana Cardot (特有種)
- 太魯閣薔薇 Rosa pricei Hayata (疑問種)
- 玉山野薔薇 Rosa sericea Lindl. var. morrisonensis (Hayata) Masam. (稀有)
- 小金櫻 Rosa taiwanensis Nakai (特有種)
- 灰葉懸鉤子 Rubus arachnoideus Liu & Lu (特有種)
- 禿懸鉤子 Rubus croceacanthus Lévl. var. glaber Koidz. (特有種)
- 梣葉懸鉤子 Rubus fraxinifoliolus Hayata (特有種)
- 桑葉懸鉤子 Rubus kawakamii Hayata (特有種)
- 蘭嶼懸鉤子 Rubus lanyuensis Chang (疑問種)
- 柳氏懸鉤子 Rubus liuii Yang & Lu (稀有)
- 尾葉懸鉤子 Rubus morii Hayata (特有種)
- 粗毛懸鉤子 Rubus nagasawanus Koidz. (特有種)
- 小梣葉懸鉤子 Rubus parviaraliifolius Hayata (特有種)
- 台東紅梅消 Rubus parvifolius L. var. toapiensis (Yamamoto) Hosok. (特有種)
- 清水懸鉤子 Rubus pseudoacer Makino subsp. flexuosus (Liu & Lu) H. Ohashi & Hsieh (特有種)
- 毛刺懸鉤子 Rubus pungens Camb. var. oldhamii (Miq.) Maxim. (特有種)
- 李棟山懸鉤子 Rubus ritozanensis Sasaki (特有種)
- 台東刺花懸鉤子 Rubus taitoensis Hayata var. taitoensis (特有種)
- 刺花懸鉤子 Rubus taitoensis Hayata var. aculeatiflorus (Hayata) H. Ohashi & Hsieh (特有種)
- 台灣莓 Rubus taiwanicolus Koidz. & Ohwi (特有種)
- 玉里懸鉤子 Rubus yuliensis Liu & Lu (特有種)
- 巒大花楸 Sorbus randaiensis (Hayata) Koidz. (特有種)
- 台灣繡線菊 Spiraea formosana Hayata (特有種)
- 假繡線菊 Spiraea hayatana Li (稀有)
- 玉山繡線菊 Spiraea morrisonicola Hayata (特有種)
- 太魯閣繡線菊 Spiraea tarokoensis Hayata (受到威脅)
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薯蕷科 Dioscoreaceae
- 掌葉薯 Dioscorea codonopsifolia Kamikoti 併入蘭嶼田薯 (疑問種)
- 基隆野山藥 Dioscorea japonica Thunb. var. pseudojaponica (Hayata) Yamamoto (特有種)
- 圓錐花薯蕷 Dioscorea kaoi T.S.Liu & T.C.Huang 併入南華薯蕷 (疑問種)
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繖羅臘藜罌蘇鐘獼臙續蘭鐵露鬚纖
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繖形科 Apiaceae
- 野當歸 Angelica dahurica (Fisch.) Benth. & Hook. var. formosana (Boiss.) Yen (疑問種)
- 濱當歸 Angelica hirsutiflora Liu, Chao & Chuang (受到威脅)
- 森氏當歸 Angelica morii Hayata (特有種)
- 玉山當歸 Angelica morrisonicola Hayata (特有種)
- 南湖當歸 Angelica morrisonicola Hayata var. nanhutashanensis Liu, Chao & Chuang (特有種)
- 太魯閣當歸 Angelica tarokoensis Hayata (受到威脅)
- 高氏柴胡 Bupleurum kaoi Liu, Chao & Chuang (瀕臨絕滅)
- 台灣芎窮 Cnidium monnieri (L.) Gusson var. formosanum (Yabe) Kitagawa (特有種)
- 玉山彎柱芎 Conioselinum morrisonense Hayata (特有種)
- 基隆天胡荽 Hydrocotyle keelungensis Liu, Chao & Chuang (疑問種)
- 阿里山天胡荽 Hydrocotyle setulosa Hayata (特有種)
- 翼莖水芹菜 Oenanthe pterocaulon Liu, Chao & Chuang (特有種)
- 山薰香 Oreomyrrhis involucrata Hayata (特有種)
- 南湖山薰香 Oreomyrrhis nanhuensis C. H. Chen & J. C. Wang (疑問種)
- 台灣山薰香 Oreomyrrhis taiwaniana Masam. (疑問種)
- 台灣前胡 Peucedanum formosanum Hayata (特有種)
- 玉山茴香 Pimpinella niitakayamensis Hayata (特有種)
- 五葉山芹菜 Sanicula petagnioides Hayata (特有種)
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羅漢松科 Podocarpaceae
- 叢花百日青 Podocarpus fasciculus de Laub. (受到威脅)
- 桃實百日青 Podocarpus nakaii Hayata (受到威脅)
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藜科 Chenopodiaceae
- 台灣藜 Chenopodium formosanum Koidz. (特有種)
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蘇鐵科 Cycadaceae
- 台東蘇鐵 Cycas taitungensis C. F. Shen, K. D. Hill, C. H. Tsou & C. J. Chen (受到威脅)
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獼猴桃科 Actinidiaceae
- 台灣羊桃 Actinidia chinensis Planch. var. setosa Li (特有種)
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續斷科 Dipsacaceae
- 玉山山蘿蔔 Scabiosa lacerifolia Hayata (特有種)
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蘭科 Orchidaceae
- 高山雛蘭 Amitostigma alpestre Fukuy. (特有種)
- 金線蓮 Anoectochilus formosanus Hayata (稀有)
- 恆春金線蓮 Anoectochilus koshunensis Hayata (稀有)
- 台灣竹葉蘭 Appendicula formosana Hayata (受到威脅)
- 長葉竹節蘭 Appendicula terrestris Fukuyama (特有種)
- 小鹿角蘭 Ascocentrum pumilum (Hayata) Schltr. (特有種)
- 白毛捲瓣蘭 Bulbophyllum albociliatum (T. S. Liu & H. J. Su) Nackejima (特有種)
- 小豆蘭 Bulbophyllum aureolabellum T. P. Lin (特有種)
- 紫紋捲瓣蘭 Bulbophyllum melanoglossum Hayata (特有種)
- 紅心豆蘭 Bulbophyllum rubrolabellum T. P. Lin (特有種)
- 鸛冠蘭 Bulbophyllum setaceum T. P. Lin (稀有)
- 台灣捲瓣蘭 Bulbophyllum taiwanense (Fukuy.) Nackejima (受到威脅)
- 小葉豆蘭 Bulbophyllum tokioi Fukuy. (稀有)
- 輻形根節蘭 Calanthe actinomorpha Fukuy. (稀有)
- 阿里山根節蘭 Calanthe arisanensis Hayata (特有種)
- 高山金蘭 Cephalanthera alpicola Fukuy. (特有種)
- 羽唇指柱蘭 Cheirostylis inabai Hayata (特有種)
- 和社指柱蘭 Cheirostylis tortilacinia C. S. Leou (受到威脅)
- 大蜘蛛蘭 Chiloschista segawae (Masam.) Masam. & Fukuy. (稀有)
- 紅盔蘭 Corybas taiwanensis T. P. Lin & S. Y. Leu (疑問種)
- 菅草蘭 Cymbidium tortisepalum Fukuyama (稀有)
- 大竹柏蘭 Cymbidium lancifolium Hook. f. var. syunitianum (Fukuy.) Ying (稀有)
- 一點紅 Cypripedium formosanum Hayata (特有種)
- 黃花老虎七 Cypripedium segawai Masam. (受到威脅)
- 雙花石斛 Dendrobium furcatopedicellatum Hayata (疑問種)
- 細莖石斛 Dendrobium leptocladum Hayata (稀有)
- 小雙花石斛 Dendrobium somai Hayata (特有種)
- 臘石斛 Epigeneium nakaharai (Schltr.) Surnmerh. (特有種)
- 台灣鈴蘭 Epipactis ohwii Fukuyama (特有種)
- 紫芋蘭 Eulophia taiwanensis Hayata (特有種)
- 尖葉暫花蘭 Flickingeria tairukounia (S. S. Ying) T. P. Lin (疑問種)
- 金松蘭 Gastrochilus flavus T. P. Lin (疑問種)
- 紅斑松蘭 Gastrochilus fuscopunctatus (Hayata) Hayata (特有種)
- 何氏松蘭 Gastrochilus hoii T. P. Lin (稀有)
- 寬唇松蘭 Gastrochilus matsudai Hayata (稀有)
- 紅檜松蘭 Gastrochilus raraensis Fukuy. (特有種)
- 無蕊喙赤箭 Gastrodia appendiculata C. S. Leou & N. J. Chung. (受到威脅)
- 夏赤箭 Gastrodia flabilabella S. S. Ying (受到威脅)
- 春赤箭 Gastrodia fontinalis T. P. Lin (受到威脅)
- 秋赤箭 Gastrodia peichatieniana S. S. Ying (特有種)
- 阿里山斑葉蘭 Goodyera arisanensis Hayata (稀有)
- 長葉斑葉蘭 Goodyera bilamellata Hayata (特有種)
- 大武斑葉蘭 Goodyera daibuzanensis Yamam. (特有種)
- 南湖斑葉蘭 Goodyera nankoensis Fukuy. (特有種)
- 哥綠懷蘭 Goodyera seikoomontana Yamam. (受到威脅)
- 蘭嶼金銀草 Goodyera yamiana Fukuy. (受到威脅)
- 小小班葉蘭 Goodyera yangmeshanensis T. P. Lin (特有種)
- 翹唇玉鳳蘭 Habenaria longiracema Fukuy. (特有種)
- 香蘭 Haraella retrocalla (Hayata) Kudo (稀有)
- 小騎士蘭 Hippeophyllum pumilum Fukuyama ex Massm. (特有種)
- 密花小騎士蘭 Hippeophyllum seidenfadenii Su (特有種)
- 蘭嶼光唇蘭 Hylophila nipponica (Fukuyama) S. S. Ying (受到威脅)
- 紋皿柱蘭 Lecanorchis thalassica T. P. Lin (受到威脅)
- 白花羊耳蘭 Liparis amabilis Fukuy. (疑問種)
- 齒唇羊耳蘭 Liparis henryi Rolfe (特有種)
- 明潭羊耳蘭 Liparis hensoaensis Kudo (疑問種)
- 尾唇羊耳蒜 Liparis krameri Franch. & Sav. var. sasakii (Hay.) T. Hashim (瀕臨絕滅)
- 虎頭石 Liparis nakaharai Hayata (特有種)
- 高士佛羊耳蘭 Liparis somai Hayata (受到威脅)
- 黃花羊耳蘭 Liparis sootenzanensis Fukuy. (特有種)
- 關山雙葉蘭 Listera kuanshanensis H. J. Su (疑問種)
- 大花雙葉蘭 Listera macrantha Fukuy. (特有種)
- 梅峰雙葉蘭 Listera meifongensis H. J. Su & C. Y. Hu (受到威脅)
- 玉山雙葉蘭 Listera morrisonicola Hayata (特有種)
- 南湖雙葉蘭 Listera nankomontana Fukuy. (受到威脅)
- 裂唇雙葉蘭 Listera pseudonipponica Fukuy. (瀕臨絕滅)
- 三角雙葉蘭 Listera suzukii Masam. (特有種)
- 大山雙葉蘭 Listera taizanensis Fukuy. (受到威脅)
- 安朔金釵蘭 Luisia cordata Fukuy. (疑問種)
- 台灣釵子股 Luisia megasepala Hayata (特有種)
- 阿里山全唇蘭 Myrmechis drymoglossifolia Hayata (特有種)
- 蘭嶼脈葉蘭 Nervilia lanyuensis S. S. Ying (疑問種)
- 大莪白蘭 Oberonia gigantea Fukuy. (瀕臨絕滅)
- 小騎士蘭 Oberonia pumila (Fukuyama ex S. C. Chen & K. Y. Lang) S. S. Ying ex Ormerod (受到威脅)
- 密花小騎士蘭 Oberonia seidenfadenii (H. J. Su) Ormerod (受到威脅)
- 大霸山蘭 Oreorchis bilamellata Fukuy. (特有種)
- 大芙樂蘭 Phreatia morii Hayata (特有種)
- 白芙樂蘭 Phreatia taiwaniana Fukuy. (稀有)
- 短距粉蝶蘭 Platanthera brevicalcarata Hayata (特有種)
- 長葉蜻蛉蘭 Platanthera devolii (T. P. Lin & T. W. Hu) T. P. Lin & K. Inoue (特有種)
- 惠粉蝶蘭 Platanthera mandarinorum Reichb. f. subsp. formosana T. P. Lin & K. Inoue (特有種)
- 厚唇粉蝶蘭 Platanthera mandarinorum Reichb. f. subsp. pachyglossa (Hayata) T. P. Lin (特有種)
- 狹唇粉蝶蘭 Platanthera stenoglossa Hayata (特有種)
- 陰粉蝶蘭 Platanthera yangmeiensis T. P. Lin (特有種)
- 黃繡球蘭 Pomatocalpa acuminata (Rolfe) Schltr. (特有種)
- 紅小蝶蘭 Ponerorchis kiraishiensis (Hayata) Ohwi (特有種)
- 台灣小蝶蘭 Ponerorchis taiwanensis (Fukuy.) Ohwi (特有種)
- 高山紅蘭 Ponerorchis takasago-montana (Masam.) Ohwi (稀有)
- 紅斑蘭 Ponerorchis tominagai (Hayata) H. J. Su & J. J. Chen (稀有)
- 扁蜘蛛蘭 Taeniophyllum complanatum Fukuy. (稀有)
- 小白蛾蘭 Thrixspermum saruwatarii (Hayata) Schltr. (特有種)
- 南湖蠅蘭 Tipularia odorata Fukuy. (特有種)
- 紅頭蘭 Tuberolabium kotoense Yamam. (受到威脅)
- 旗唇蘭 Vexillabium integrum (Fukuy.) S. S. Ying (受到威脅)
- 全唇線柱蘭 Zeuxine integrilabella C. S. Leou (稀有)
- 裂唇線柱蘭 Zeuxine tabiyahanensis (Hayata) Hayata (稀有)
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